Senter for anvendt medisinsk bioinformatikk – sluttrapport for TMFs støtte

Med støtte fra Trond Mohn forskningsstiftelse (TMF) har Senter for anvendt medisinsk bioinformatikk (SAMB), ledet av professor Vidar M. Steen, bidratt til å bygge opp et sterkt miljø for analyse av store biologiske datamengder ved Haukeland universitetssjukehus og Det medisinske fakultet (UiB).

Etablering av et høyt etterspurt kompetansemiljø

Gjennom prosjektperioden har SAMB etablert en bioinformatisk støttefunksjon, tett integrert med Genomics Core Facility (GCF) ved Universitetet i Bergen. Med støtte fra TMF ble det mulig å ansette dedikert bioinformatisk kompetanse over lang tid, og å utvikle tekniske løsninger for sikker lagring og analyse av store datasett – særlig innen genomforskning.

Resultatet er et analyse‑ og støttemiljø for blant annet helgenomsekvensering‑ og RNA‑sekvensering, som inkluderer bruk av UiBs løsning for håndtering av sensitive helsedata (SAFE). Infrastrukturen brukes både i forskning og i klinisk sammenheng. Gjennom prosjektet har Bergen blitt del av «Nordic Alliance for Clinical Genomics (NACG).

Viktig støtte for forskning, datahåndtering og helsetjenester

SAMB har gjennom årene bidratt til et bredt spekter av forskningsprosjekter innen blant annet kreft, fedme, diabetes, infeksjonssykdommer, psykiatri, sjeldne arvelige sykdommer og regenerativ medisin – men også marinbiologiske områder. Støtten har variert fra rådgivning i planlegging av studier til avansert dataanalyse i store og komplekse prosjekter. Satsingen har også bidratt til trygg overføring av store mengder sensitive data mellom institusjoner.

Arbeidet har også gitt konkrete resultater i form av vitenskapelige publikasjoner og styrket genomikkbasert diagnostikk, som blant annet infeksjonssykdommer og sjeldne arvelige sykdommer. Under koronapandemien spilte prosjektet en viktig rolle med sekvenseringskompetanse som var viktig i utviklingen av koronatester (i samarbeid med UiO).